Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SbdsP70122 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SbdsP70122 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms