Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms