Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smg6P61406 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms