Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ActbP60710 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ActbP60710 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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