Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rin3P59729 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rin3P59729 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rin3P59729 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rin3P59729 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms