Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr3bP59470 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms