Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarf2P59222 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms