Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhbdl3P58873 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhbdl3P58873 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms