Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GemP55041 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GemP55041 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GemP55041 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GemP55041 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GemP55041 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms