Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PctpP53808 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PctpP53808 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PctpP53808 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms