Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cux1P53564 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cux1P53564 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms