Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upp1P52624 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Upp1P52624 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms