Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ube2e3P52483 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms