Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apobec1P51908 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms