Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr5P51682 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms