Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FanccP50652 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FanccP50652 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FanccP50652 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms