Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TubP50586 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TubP50586 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TubP50586 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TubP50586 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms