Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgavP43406 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms