Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gdf5P43027 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gdf5P43027 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms