Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vps26aP40336 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vps26aP40336 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms