Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd22P35329 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd22P35329 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms