Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mmp13P33435 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Mmp13P33435 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms