Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnna1P26231 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms