Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd247P24161 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms