Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tpm3P21107 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms