Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a2P20490 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms