Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P20040 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P20040 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P20040 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P20040 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P20040 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P20040 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P20040 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
P20040 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
P20040 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P20040 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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