Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnnc1P19123 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms