Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gata1P17679 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gata1P17679 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gata1P17679 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms