Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou4f1P17208 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms