Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gabra6P16305 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms