Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vpreb2P13373 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms