Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt8P11679 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt8P11679 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms