Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
P10404 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
P10404 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
P10404 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
P10404 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P10404 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms