Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccl2P10148 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccl2P10148 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms