Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CatspereP0DP43 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CatspereP0DP43 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms