Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf2P09926 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf2P09926 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf2P09926 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf2P09926 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf2P09926 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms