Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spta1P08032 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Spta1P08032 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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