Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HbaP01942 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms