Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcn2O88703 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcn2O88703 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms