Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp2O88623 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp2O88623 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms