Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AurkcO88445 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AurkcO88445 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AurkcO88445 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AurkcO88445 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AurkcO88445 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms