Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xirp1O70373 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xirp1O70373 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms