Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RngttO55236 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RngttO55236 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RngttO55236 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms