Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx4O55187 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms