Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc3O55013 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms