Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pole2O54956 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms