Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ChkaO54804 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChkaO54804 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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