Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phox2bO35690 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms