Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Edil3O35474 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Edil3O35474 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms